Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C11orf49Q9H6J7 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms