Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLSTN2Q9H4D0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms