Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3N1

TMX1, Thioredoxin-related transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX1Q9H3N1 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMX1Q9H3N1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms