Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C1

LHX5, LIM/homeobox protein Lhx5, humanhuman

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Length 402 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX5Q9H2C1 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LHX5Q9H2C1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LHX5Q9H2C1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LHX5Q9H2C1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LHX5Q9H2C1 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LHX5Q9H2C1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LHX5Q9H2C1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LHX5Q9H2C1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LHX5Q9H2C1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LHX5Q9H2C1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LHX5Q9H2C1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LHX5Q9H2C1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LHX5Q9H2C1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LHX5Q9H2C1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LHX5Q9H2C1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LHX5Q9H2C1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LHX5Q9H2C1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LHX5Q9H2C1 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LHX5Q9H2C1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LHX5Q9H2C1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LHX5Q9H2C1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LHX5Q9H2C1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LHX5Q9H2C1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LHX5Q9H2C1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LHX5Q9H2C1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LHX5Q9H2C1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LHX5Q9H2C1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LHX5Q9H2C1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LHX5Q9H2C1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LHX5Q9H2C1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LHX5Q9H2C1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LHX5Q9H2C1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LHX5Q9H2C1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LHX5Q9H2C1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LHX5Q9H2C1 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LHX5Q9H2C1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LHX5Q9H2C1 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LHX5Q9H2C1 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LHX5Q9H2C1 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LHX5Q9H2C1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
LHX5Q9H2C1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LHX5Q9H2C1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LHX5Q9H2C1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LHX5Q9H2C1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LHX5Q9H2C1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LHX5Q9H2C1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
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