Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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HOXD1Q9GZZ0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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HOXD1Q9GZZ0 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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HOXD1Q9GZZ0 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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