Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRCC1Q9C099 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms