Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE4

GTPBP4, Nucleolar GTP-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP4Q9BZE4 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTPBP4Q9BZE4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms