Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CELF4Q9BZC1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms