Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY77

POLDIP3, Polymerase delta-interacting protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLDIP3Q9BY77 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLDIP3Q9BY77 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
POLDIP3Q9BY77 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLDIP3Q9BY77 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLDIP3Q9BY77 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLDIP3Q9BY77 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms