Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms