Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.27■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms