Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWE0

REPIN1, Replication initiator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPIN1Q9BWE0 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms