Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
HIRIP3Q9BW71 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HIRIP3Q9BW71 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms