Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVV2

FNDC11, Fibronectin type III domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC11Q9BVV2 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNDC11Q9BVV2 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNDC11Q9BVV2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNDC11Q9BVV2 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNDC11Q9BVV2 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNDC11Q9BVV2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNDC11Q9BVV2 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNDC11Q9BVV2 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNDC11Q9BVV2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNDC11Q9BVV2 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNDC11Q9BVV2 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNDC11Q9BVV2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNDC11Q9BVV2 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNDC11Q9BVV2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNDC11Q9BVV2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNDC11Q9BVV2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNDC11Q9BVV2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNDC11Q9BVV2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNDC11Q9BVV2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNDC11Q9BVV2 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FNDC11Q9BVV2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNDC11Q9BVV2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNDC11Q9BVV2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNDC11Q9BVV2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNDC11Q9BVV2 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNDC11Q9BVV2 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNDC11Q9BVV2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNDC11Q9BVV2 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNDC11Q9BVV2 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNDC11Q9BVV2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNDC11Q9BVV2 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNDC11Q9BVV2 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNDC11Q9BVV2 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNDC11Q9BVV2 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNDC11Q9BVV2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNDC11Q9BVV2 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNDC11Q9BVV2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNDC11Q9BVV2 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNDC11Q9BVV2 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNDC11Q9BVV2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNDC11Q9BVV2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNDC11Q9BVV2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNDC11Q9BVV2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNDC11Q9BVV2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNDC11Q9BVV2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNDC11Q9BVV2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNDC11Q9BVV2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNDC11Q9BVV2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNDC11Q9BVV2 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNDC11Q9BVV2 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNDC11Q9BVV2 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNDC11Q9BVV2 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNDC11Q9BVV2 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNDC11Q9BVV2 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNDC11Q9BVV2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNDC11Q9BVV2 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNDC11Q9BVV2 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNDC11Q9BVV2 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNDC11Q9BVV2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms