Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms