Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT76

UPK3B, Uroplakin-3b, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BQ9BT76 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UPK3BQ9BT76 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
UPK3BQ9BT76 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
UPK3BQ9BT76 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
UPK3BQ9BT76 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
UPK3BQ9BT76 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
UPK3BQ9BT76 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
UPK3BQ9BT76 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UPK3BQ9BT76 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UPK3BQ9BT76 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UPK3BQ9BT76 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UPK3BQ9BT76 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UPK3BQ9BT76 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UPK3BQ9BT76 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UPK3BQ9BT76 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UPK3BQ9BT76 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UPK3BQ9BT76 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UPK3BQ9BT76 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UPK3BQ9BT76 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UPK3BQ9BT76 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UPK3BQ9BT76 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UPK3BQ9BT76 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UPK3BQ9BT76 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UPK3BQ9BT76 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UPK3BQ9BT76 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
UPK3BQ9BT76 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UPK3BQ9BT76 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UPK3BQ9BT76 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UPK3BQ9BT76 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UPK3BQ9BT76 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UPK3BQ9BT76 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UPK3BQ9BT76 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UPK3BQ9BT76 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UPK3BQ9BT76 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UPK3BQ9BT76 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UPK3BQ9BT76 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UPK3BQ9BT76 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
UPK3BQ9BT76 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
UPK3BQ9BT76 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
UPK3BQ9BT76 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
UPK3BQ9BT76 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
UPK3BQ9BT76 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
UPK3BQ9BT76 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
UPK3BQ9BT76 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
UPK3BQ9BT76 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
UPK3BQ9BT76 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
UPK3BQ9BT76 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
UPK3BQ9BT76 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
UPK3BQ9BT76 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
UPK3BQ9BT76 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
UPK3BQ9BT76 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
UPK3BQ9BT76 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
UPK3BQ9BT76 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
UPK3BQ9BT76 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
UPK3BQ9BT76 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
UPK3BQ9BT76 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
UPK3BQ9BT76 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
UPK3BQ9BT76 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
UPK3BQ9BT76 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
UPK3BQ9BT76 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
UPK3BQ9BT76 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
UPK3BQ9BT76 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
UPK3BQ9BT76 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
UPK3BQ9BT76 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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