Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms