Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP3BQ9BS92 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms