Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BPIFA3Q9BQP9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms