Protein–RNA interactions for Protein: Q99795

GPA33, Cell surface A33 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPA33Q99795 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GPA33Q99795 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPA33Q99795 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms