Protein–RNA interactions for Protein: Q99590

SCAF11, Protein SCAF11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF11Q99590 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SCAF11Q99590 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms