Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SIN3AQ96ST3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SIN3AQ96ST3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SIN3AQ96ST3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SIN3AQ96ST3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SIN3AQ96ST3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SIN3AQ96ST3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SIN3AQ96ST3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SIN3AQ96ST3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SIN3AQ96ST3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SIN3AQ96ST3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SIN3AQ96ST3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SIN3AQ96ST3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SIN3AQ96ST3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SIN3AQ96ST3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms