Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.33■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALS2CR12Q96Q35 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms