Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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