Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SORCS2Q96PQ0 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms