Protein–RNA interactions for Protein: Q96NT0

CCDC115, Coiled-coil domain-containing protein 115, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC115Q96NT0 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC115Q96NT0 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms