Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAPZA3Q96KX2 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms