Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
VCPIP1Q96JH7 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VCPIP1Q96JH7 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms