Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms