Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCMH1Q96GD3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCMH1Q96GD3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCMH1Q96GD3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCMH1Q96GD3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCMH1Q96GD3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCMH1Q96GD3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCMH1Q96GD3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCMH1Q96GD3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCMH1Q96GD3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCMH1Q96GD3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCMH1Q96GD3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCMH1Q96GD3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCMH1Q96GD3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCMH1Q96GD3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCMH1Q96GD3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCMH1Q96GD3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCMH1Q96GD3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCMH1Q96GD3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCMH1Q96GD3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCMH1Q96GD3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCMH1Q96GD3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SCMH1Q96GD3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCMH1Q96GD3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCMH1Q96GD3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCMH1Q96GD3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCMH1Q96GD3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCMH1Q96GD3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCMH1Q96GD3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCMH1Q96GD3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
SCMH1Q96GD3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SCMH1Q96GD3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SCMH1Q96GD3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SCMH1Q96GD3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SCMH1Q96GD3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SCMH1Q96GD3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SCMH1Q96GD3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCMH1Q96GD3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCMH1Q96GD3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCMH1Q96GD3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCMH1Q96GD3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCMH1Q96GD3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCMH1Q96GD3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCMH1Q96GD3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCMH1Q96GD3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCMH1Q96GD3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SCMH1Q96GD3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCMH1Q96GD3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCMH1Q96GD3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCMH1Q96GD3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCMH1Q96GD3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SCMH1Q96GD3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCMH1Q96GD3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCMH1Q96GD3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCMH1Q96GD3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCMH1Q96GD3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCMH1Q96GD3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCMH1Q96GD3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCMH1Q96GD3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCMH1Q96GD3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCMH1Q96GD3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCMH1Q96GD3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCMH1Q96GD3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCMH1Q96GD3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCMH1Q96GD3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCMH1Q96GD3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCMH1Q96GD3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCMH1Q96GD3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCMH1Q96GD3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCMH1Q96GD3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCMH1Q96GD3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCMH1Q96GD3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCMH1Q96GD3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCMH1Q96GD3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCMH1Q96GD3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCMH1Q96GD3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCMH1Q96GD3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCMH1Q96GD3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCMH1Q96GD3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCMH1Q96GD3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCMH1Q96GD3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SCMH1Q96GD3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCMH1Q96GD3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCMH1Q96GD3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCMH1Q96GD3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCMH1Q96GD3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCMH1Q96GD3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCMH1Q96GD3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCMH1Q96GD3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCMH1Q96GD3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCMH1Q96GD3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCMH1Q96GD3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCMH1Q96GD3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCMH1Q96GD3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCMH1Q96GD3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCMH1Q96GD3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCMH1Q96GD3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCMH1Q96GD3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCMH1Q96GD3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCMH1Q96GD3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms