Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms