Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX7

TRIM44, Tripartite motif-containing protein 44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM44Q96DX7 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM44Q96DX7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms