Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 637 ms