Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
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