Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPTSSAQ969W0 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPTSSAQ969W0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPTSSAQ969W0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPTSSAQ969W0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SPTSSAQ969W0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPTSSAQ969W0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPTSSAQ969W0 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPTSSAQ969W0 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPTSSAQ969W0 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SPTSSAQ969W0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPTSSAQ969W0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPTSSAQ969W0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPTSSAQ969W0 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPTSSAQ969W0 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPTSSAQ969W0 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPTSSAQ969W0 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPTSSAQ969W0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPTSSAQ969W0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPTSSAQ969W0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPTSSAQ969W0 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPTSSAQ969W0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPTSSAQ969W0 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPTSSAQ969W0 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPTSSAQ969W0 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPTSSAQ969W0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPTSSAQ969W0 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPTSSAQ969W0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPTSSAQ969W0 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SPTSSAQ969W0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPTSSAQ969W0 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPTSSAQ969W0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPTSSAQ969W0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPTSSAQ969W0 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPTSSAQ969W0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPTSSAQ969W0 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPTSSAQ969W0 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPTSSAQ969W0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPTSSAQ969W0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPTSSAQ969W0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPTSSAQ969W0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPTSSAQ969W0 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPTSSAQ969W0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPTSSAQ969W0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPTSSAQ969W0 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPTSSAQ969W0 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPTSSAQ969W0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPTSSAQ969W0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPTSSAQ969W0 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPTSSAQ969W0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPTSSAQ969W0 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPTSSAQ969W0 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPTSSAQ969W0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPTSSAQ969W0 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPTSSAQ969W0 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPTSSAQ969W0 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SPTSSAQ969W0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPTSSAQ969W0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
SPTSSAQ969W0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPTSSAQ969W0 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPTSSAQ969W0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPTSSAQ969W0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPTSSAQ969W0 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPTSSAQ969W0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPTSSAQ969W0 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPTSSAQ969W0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPTSSAQ969W0 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPTSSAQ969W0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPTSSAQ969W0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPTSSAQ969W0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPTSSAQ969W0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPTSSAQ969W0 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPTSSAQ969W0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SPTSSAQ969W0 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPTSSAQ969W0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPTSSAQ969W0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPTSSAQ969W0 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SPTSSAQ969W0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPTSSAQ969W0 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPTSSAQ969W0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPTSSAQ969W0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPTSSAQ969W0 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPTSSAQ969W0 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPTSSAQ969W0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPTSSAQ969W0 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPTSSAQ969W0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPTSSAQ969W0 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTSSAQ969W0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTSSAQ969W0 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTSSAQ969W0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTSSAQ969W0 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTSSAQ969W0 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTSSAQ969W0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTSSAQ969W0 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTSSAQ969W0 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTSSAQ969W0 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTSSAQ969W0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTSSAQ969W0 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTSSAQ969W0 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPTSSAQ969W0 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms