Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDAQ92838 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDAQ92838 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDAQ92838 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDAQ92838 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDAQ92838 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDAQ92838 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDAQ92838 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDAQ92838 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDAQ92838 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDAQ92838 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDAQ92838 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDAQ92838 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EDAQ92838 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EDAQ92838 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EDAQ92838 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EDAQ92838 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EDAQ92838 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EDAQ92838 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EDAQ92838 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EDAQ92838 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EDAQ92838 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
EDAQ92838 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
EDAQ92838 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
EDAQ92838 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EDAQ92838 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EDAQ92838 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EDAQ92838 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EDAQ92838 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EDAQ92838 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EDAQ92838 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EDAQ92838 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EDAQ92838 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
EDAQ92838 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EDAQ92838 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EDAQ92838 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EDAQ92838 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EDAQ92838 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EDAQ92838 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EDAQ92838 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EDAQ92838 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EDAQ92838 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EDAQ92838 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EDAQ92838 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EDAQ92838 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EDAQ92838 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EDAQ92838 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EDAQ92838 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EDAQ92838 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EDAQ92838 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EDAQ92838 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EDAQ92838 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EDAQ92838 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EDAQ92838 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EDAQ92838 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EDAQ92838 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EDAQ92838 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EDAQ92838 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EDAQ92838 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EDAQ92838 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EDAQ92838 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EDAQ92838 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EDAQ92838 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EDAQ92838 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EDAQ92838 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EDAQ92838 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EDAQ92838 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EDAQ92838 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EDAQ92838 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EDAQ92838 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
EDAQ92838 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
EDAQ92838 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
EDAQ92838 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
EDAQ92838 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
EDAQ92838 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
EDAQ92838 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EDAQ92838 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EDAQ92838 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EDAQ92838 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EDAQ92838 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EDAQ92838 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EDAQ92838 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EDAQ92838 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EDAQ92838 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EDAQ92838 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EDAQ92838 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EDAQ92838 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EDAQ92838 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
EDAQ92838 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EDAQ92838 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EDAQ92838 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EDAQ92838 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EDAQ92838 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EDAQ92838 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
EDAQ92838 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EDAQ92838 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EDAQ92838 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EDAQ92838 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EDAQ92838 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EDAQ92838 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms