Protein–RNA interactions for Protein: Q92738

USP6NL, USP6 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6NLQ92738 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP6NLQ92738 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms