Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF1

PSPC1, Paraspeckle component 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1Q8WXF1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSPC1Q8WXF1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
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