Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUA8

TSKU, Tsukushin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKUQ8WUA8 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TSKUQ8WUA8 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TSKUQ8WUA8 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TSKUQ8WUA8 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TSKUQ8WUA8 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TSKUQ8WUA8 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TSKUQ8WUA8 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TSKUQ8WUA8 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TSKUQ8WUA8 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
TSKUQ8WUA8 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TSKUQ8WUA8 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TSKUQ8WUA8 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TSKUQ8WUA8 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TSKUQ8WUA8 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TSKUQ8WUA8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TSKUQ8WUA8 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TSKUQ8WUA8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TSKUQ8WUA8 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TSKUQ8WUA8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TSKUQ8WUA8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TSKUQ8WUA8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TSKUQ8WUA8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TSKUQ8WUA8 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms