Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG4

HELQ, Helicase POLQ-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELQQ8TDG4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HELQQ8TDG4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HELQQ8TDG4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HELQQ8TDG4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HELQQ8TDG4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HELQQ8TDG4 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HELQQ8TDG4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HELQQ8TDG4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HELQQ8TDG4 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HELQQ8TDG4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HELQQ8TDG4 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HELQQ8TDG4 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HELQQ8TDG4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HELQQ8TDG4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HELQQ8TDG4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HELQQ8TDG4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HELQQ8TDG4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HELQQ8TDG4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HELQQ8TDG4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HELQQ8TDG4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HELQQ8TDG4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HELQQ8TDG4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HELQQ8TDG4 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HELQQ8TDG4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HELQQ8TDG4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HELQQ8TDG4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HELQQ8TDG4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HELQQ8TDG4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HELQQ8TDG4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HELQQ8TDG4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HELQQ8TDG4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HELQQ8TDG4 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HELQQ8TDG4 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HELQQ8TDG4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HELQQ8TDG4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HELQQ8TDG4 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HELQQ8TDG4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HELQQ8TDG4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HELQQ8TDG4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HELQQ8TDG4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HELQQ8TDG4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HELQQ8TDG4 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HELQQ8TDG4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HELQQ8TDG4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HELQQ8TDG4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HELQQ8TDG4 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HELQQ8TDG4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HELQQ8TDG4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms