Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms