Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I0

SYT2, Synaptotagmin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT2Q8N9I0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYT2Q8N9I0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT2Q8N9I0 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms