Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G5

CSGALNACT2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, humanhuman

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Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSGALNACT2Q8N6G5 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
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