Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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CHCHD4Q8N4Q1 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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CHCHD4Q8N4Q1 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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CHCHD4Q8N4Q1 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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CHCHD4Q8N4Q1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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CHCHD4Q8N4Q1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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CHCHD4Q8N4Q1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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CHCHD4Q8N4Q1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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CHCHD4Q8N4Q1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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CHCHD4Q8N4Q1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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CHCHD4Q8N4Q1 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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