Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SVBPQ8N300 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms