Protein–RNA interactions for Protein: Q8N239

KLHL34, Kelch-like protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL34Q8N239 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL34Q8N239 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL34Q8N239 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL34Q8N239 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL34Q8N239 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL34Q8N239 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL34Q8N239 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL34Q8N239 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL34Q8N239 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL34Q8N239 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL34Q8N239 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL34Q8N239 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL34Q8N239 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL34Q8N239 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL34Q8N239 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL34Q8N239 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL34Q8N239 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL34Q8N239 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KLHL34Q8N239 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KLHL34Q8N239 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KLHL34Q8N239 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms