Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms