Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB11FIP4Q86YS3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms