Protein–RNA interactions for Protein: Q86W67

FAM228A, Protein FAM228A, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228AQ86W67 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM228AQ86W67 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM228AQ86W67 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM228AQ86W67 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM228AQ86W67 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM228AQ86W67 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM228AQ86W67 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM228AQ86W67 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM228AQ86W67 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM228AQ86W67 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM228AQ86W67 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM228AQ86W67 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM228AQ86W67 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM228AQ86W67 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM228AQ86W67 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM228AQ86W67 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM228AQ86W67 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM228AQ86W67 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM228AQ86W67 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM228AQ86W67 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM228AQ86W67 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM228AQ86W67 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM228AQ86W67 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM228AQ86W67 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM228AQ86W67 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM228AQ86W67 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM228AQ86W67 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM228AQ86W67 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM228AQ86W67 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM228AQ86W67 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM228AQ86W67 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM228AQ86W67 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM228AQ86W67 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM228AQ86W67 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM228AQ86W67 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM228AQ86W67 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM228AQ86W67 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM228AQ86W67 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM228AQ86W67 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM228AQ86W67 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM228AQ86W67 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM228AQ86W67 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM228AQ86W67 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM228AQ86W67 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM228AQ86W67 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM228AQ86W67 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM228AQ86W67 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM228AQ86W67 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM228AQ86W67 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM228AQ86W67 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM228AQ86W67 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM228AQ86W67 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM228AQ86W67 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM228AQ86W67 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM228AQ86W67 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM228AQ86W67 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM228AQ86W67 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM228AQ86W67 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM228AQ86W67 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM228AQ86W67 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM228AQ86W67 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM228AQ86W67 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM228AQ86W67 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM228AQ86W67 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM228AQ86W67 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM228AQ86W67 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM228AQ86W67 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM228AQ86W67 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM228AQ86W67 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM228AQ86W67 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
FAM228AQ86W67 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM228AQ86W67 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM228AQ86W67 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM228AQ86W67 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM228AQ86W67 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM228AQ86W67 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM228AQ86W67 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM228AQ86W67 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM228AQ86W67 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM228AQ86W67 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM228AQ86W67 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM228AQ86W67 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM228AQ86W67 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM228AQ86W67 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM228AQ86W67 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM228AQ86W67 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM228AQ86W67 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM228AQ86W67 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM228AQ86W67 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM228AQ86W67 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM228AQ86W67 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM228AQ86W67 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM228AQ86W67 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM228AQ86W67 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM228AQ86W67 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM228AQ86W67 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM228AQ86W67 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM228AQ86W67 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM228AQ86W67 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM228AQ86W67 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms