Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP54Q7Z3B4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms